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Calcular promedio por cada valor n

Haces un vector dummy de 9 valores y quires sacar el promedio cada 3 valores.

a<-c(1,1,1,2,2,2,3,3,3)
Si usas tapply, puedes usar algo así donde le dices el número de valores en la secuencia de tu vector. En este caso le estoy diciendo que haga un promedio cada tres valores.

b<-tapply(a, rep(seq_along(a), each = 3, length.out = length(a)), mean)

El resultado es una matrix pero lo puede hacer data frame si quieres

b2<-as.data.frame(b)

Para automatizarlo, al inicio del script podrías hacer unas “Initial conditions section” Que diga.

#Número de días que quiero agrupar
dias<-3

Y luego ya puedes correr tu código substituyendo el 3 con “dias”.  Por ejemplo:

b<-tapply(a, rep(seq_along(a), each = dias, length.out = length(a)), mean)

Cool Browser add ons

Several tools make my life easier, and I have reached a point where I cannot leave without them. Here is a couple of these browser tools for example:

Gmail reverse conversation

This is a great tool to put the most recent email on top o a thread. Follow this link for more significant detail about the applicability of this add-on for Chrome or Brave https://www.gmail-reverse-conversation.com/ or you can download it and install in your browser at this link https://chrome.google.com/webstore/detail/gmail-conversation-thread/fkplphcelnmocakmefjmpnohnfgkibkk/related?hl=es/

Open windows instead of tabs

One of the must-have add-ons on my browser is this https://chrome.google.com/webstore/detail/new-tab-new-window/dndlcbaomdoggooaficldplkcmkfpgff

if your workflow gets crowded with tabs, you should try this.

Como arreglar adeudos Conacyt

Tratando de llenar la convocatoria de ciencia de Frontera Conacyt 2022 me encontré con adeudos. Esto fue lo que tuve que hacer para solucinarlo:

Para la convocatoria de Ciencia de Frontera 2023, a quienes les manda error por termino de vigencia de beca, se debe a que en el sistema peoplesoft no han solicitado la carta de reconocimiento, yo tenía pendientes enviar los títulos de maestría y doctorado, qué hacer?

En mozilla ir a https://people.conacyt.mx/generador-view…/index.html…

1. Primero dar click en firma electrónica y actualizarla (en reestablecer firma dar click en enviar código de cancelación, luego en su correo copian el código de confirmación y lo pegan en “Ingresar Código de Cancelación”, siguen el procedimiento para ingresar la nueva firma electrónica.

2. En el sistema PeopleSoft van a #Ex Becarios” –>”Solicitud C Liberacion/No Ade” — “Buscar” y dan click en la beca que tengan pendiente

3. Suben titulo escaneado por ambos lados, llenan todos los campos, ponen su firma electrónica que actualizaron y le dan en enviar.

4. Les debe llegar un correo de confirmación

5. Esperen 30 días y listo, yo después ya pude capturar mi solicitud de CF pero me manda una aviso de que tengo pendiente ese trámite de la beca y que si no lo subsano es probable que la soliuno sea evaluada, después de estar capturando la propuesta ya me dejó de salir dicho aviso. Suerte

P.D. Recomiendo hacer esto aunque no vayan a participar en Ciencia de Frontera, igual para cualquier otra convocatoria ya sea de investigación o ingreso, permanencia en el SNI lo van a pedir

Dive Gear Lost

I have lost my SUBA gear. I need your help to spot any of my gear in the different online outlets. As you know is very valuable both economically and personally. It is also an essential part of my work. Thank you in advance for any information if you see any of these around.

Gear Bag Black and Blue

This is the Dive Bag all the gear was stored. I know this is not the best picture, but at least you can see the dimension.

Buoyancy compressor

This is an OMS technical BCS with 45 pound lift capacity. It has rings all over the straps and an elastic rope around the wing.

Fins

These are the Force Fins. This is the original model, and it was size L.

Booties

Solite 2021 3mm custom bootie. This pair is size 9US.

Path Bar en Finder

Para mostrar la ubicación del nombre de los archivos en Finder

A veces es importante saber cual es la ubicación de algún archivo en tu finder. Este método te permite verlo a todo momoento arriba a la izq del finder. Para esto, tienes que utilizar la terminal de mac.

To enable the Finder’s title bar to display the long pathname, do the following:

  1. Launch Terminal, located at /Applications/Utilities/.

  2. At the Terminal command prompt, enter the following:

    defaults write com.apple.finder _FXShowPosixPathInTitle -bool true
</pre data-type="code">

    You can triple-click the Terminal command here to select the entire line of text and then copy/paste the line into your Terminal window.

  3. Press Enter or Return.

  4. At the Terminal prompt, enter:

    killall Finder

  5. Press Enter or Return.

The Finder restarts, after which any Finder window displays the long pathname to the current location of a folder.

Disable Display of the Full Pathname

If you decide you don’t like the Finder always displaying the long pathname, you can turn the feature off with the following Terminal commands:

  1. At the Terminal command prompt, enter the following:

    defaults write com.apple.finder _FXShowPosixPathInTitle -bool false

  2. Press Enter or Return.

  3. At the Terminal prompt, enter:

    killall Finder

  4. Press Enter or Return.

The Finder Path Bar and the related path features of the Finder can be a handy shortcut when working with files and folders. Give this nifty hidden feature a try.

Mark Carr visits UABC

Informe de actividades de la visita del Dr. Mark H. Carr a la Facultad de Ciencias Marinas, UABC

El Dr. Mark H. Carr, profesor de la Universidad de California en Santa Cruz, con el apoyo de la Universidad Autónoma de Baja California visitó la Facultad de Ciencias Marinas del 21 al 25 de agosto del 2016. Durante su vista el Dr. Carr estuvo involucrado en las siguientes actividades académicas.

Dio una plática sobre su investigación que desarrolla con los bosques de sargazo de M. Pyrifera en  California. Esta charla la impartió en el seminario del doctorado de Medio Ambiente y desarrollo. Su plática se tituló: “Causas y consecuencias de patrones geográficos en la estructura de la comunidad de bosques submarinos.  Eu su seminario, discutió ¿Cómo varían las comunidades (en espacio) y por qué?, ¿Qué procesos ecológicos y ambientales explican esta variación?, ¿Son consistentes  estos patrones con sus correlaciones ambientales entre los grupos que forman las comunidades? ¿Concuerdan los patrones taxonómicos y estructurales con la diversidad espacial? El Dr. Carr tiene mucha experiencia en el manejo y conservación de ecosistemas marinos costeros. Mucho del conocimiento que ha generado en su carrera ya se ha utilizado para el diseño e implementación  la red de reservas marinas más extensa en el mundo (California). Además, es uno de los responsables de uno de los programas de monitoreo ecológico más reconocidos PISCO (Partneship for Interdisiplinary Studies of Coastal Oceans).

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Foto 1. El Dr. Carr durante el seminario del Doctorado de Medio Ambiente y Desarrollo en el IIO.

El Dr. Carr participó en un taller que organizamos con estudiantes de posgrado de los diferentes programas. Los estudiantes presentaron sus proyectos de investigación en un formato formal con pláticas con una duración de 15 minutos cada una más 5 minutos de preguntas. El Dr. Carr, liderio la discusión, observaciones y sugerencias a los diferentes proyectos que se discutieron en este taller. Además, con este ejercicio, construimos una vinculación estrecha entre los estudiantes de los diferentes posgrados y el laboratorio del Dr. Carr.

img_9339Foto 2. Grupo de investigadores y estudiantes que participaron en el taller. De izquierda a derecha de arriba abajo, Eduardo Gonzales (FC), M en C Mayra Hernández (Estudiante posgrado MyD) , Dr. Guillermo Torres (FCM) , Dra. Gabriela Montaño(IIO), Dr. Rodrigo Beas(FCM), Ocea. Nur Arafeh (UABC),Ocea. Ainoa Vilalta (CICESE), Dr. Mark Carr (UCSC), Rodrigo Calderón (estudiante Lic. OC), Alvaro San José (estudiante Lic. CA), M en C Alfonso Medellín (estudiante posgrado EC), y Hector Hernández. (estudiante Lic. Biol).

Tuvimos la oportunidad de salir al campo y mostrarle uno de nuestros sitios de monitoreo ecológico. Fuimos a Campo Kennedy en el lado expuesto de Punta Banda. En esta salida de campo, involucramos a varios estudiantes de la facultad de Ciencias y Facultad de Ciencias Marinas para que tuvieran la oportunidad de interactuar en el campo con una de las personalidades más reconocidas en el gremio de los monitoreos ecológicos submareales. En esta actividad, llevamos a cabo un buceo utilizando equipo SCUBA del Cuerpo Académico de  Ecología y Conservación de Recursos Marinos.

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Foto 3. Panorámica de Campo Kennedy. En ese sitio practicamos métodos de colecta submarina utilizando transectos de banda y cuadrantes. De izquierda a derecha: Rodrigo Calderón (estudiante de OC), Héctor Hernández (estudiante de Biol.), Itzel González (estudiante de CA), Andrea La Paz (estudiante de CA), y el Dr. Mark Carr (UCSC).
Durante su visita, finalizamos las correcciones de un manuscrito para publicación en la revista BioScience. Además discutimos un modelo conceptual de la interacción de las pesquerías y el cambio climático.

img_9346En general, la visita del Dr. Carr fue muy productiva. Especialmente fue importante para los estudiantes de posgrado y licenciatura ya que tuvieron de estar en contacto cercano con uno de los investigadores más reconocidos en su gremio.

 

Kelp forests from Bering to Baja

Monitoring kelp forests ecosystems in the west coast of US and Mexico: past, present and future.

Species associated with kelp forest ecosystems in the west coast of US and Mexico show a great variation in abundance and diversity. We are interested on how this ecosystem will respond to different sources of variation (e.g. Climate change, Fishing, Pollution)  along the coast given the differences in both function and structure in the latitudinal gradient.

This image shows the macroalgae distribution along the coast of US, Canada and Baja California.

Figure03

The aim of this project is to integrate the existing data collected from different monitoring programs along the coast of the United States and Mexico. Particularly:

  • Review monitoring programs in the west coast of the US and Mexico.
  • How to keep this monitoring programs going?  What is the future for these programs?
  • Prioritize and reconcile monitoring goals and questions:
    • Ecological communities response to environmental variability
    • MPAs effects and functioning.
    • Marine reserves as a way to involve users.
  •  Identify ecological attributes of coastal marine communities that are more susceptible to environmental drivers.
  • Create a multidisciplinary research and education consortium to conduct comparative studies.

Monitoring programs

This is a list of some monitoring programs in this area:

– BCMP (Baja California Monitoring Program)
– PISCO (Partnership for Interdisciplinary studies of Coastal Oceans)
– Channel Islands LTER (Long term ecological research)
– California ReefCheck
– Alaska Monitoring Program
– Canada Outer Shores

Kelp forest ecosystems

We are focusing our efforts in analysing the variance of the abundance of the different functional groups that represent the different kelp forests. For example, these images show the different species compositions of a set  of functional groups at different locations in California and Baja California.

 

rodrigo_beas_norcal

rodrigo_beas_central_california

Rodrigo_ southern_california rodrigo_beas_baja_california

Images courtesy from: Carr, M.H. and D.C. Reed. In press. Chapter 17: Shallow Rocky Reefs and Kelp Forests. In: H. Mooney and E. Zavaleta (eds) Ecosystems of California. Berkeley: University of California Press